Hola,
Para hacer la asociación a un programa, extensión, etc. se hace así en Windows 10:
Cambiar con que aplicación se abre un archivo
Pero no te va a dejar quitar la asociación, te deja que cambies por otra de las posibles.
Te da la opción de restablecer los valores predeterminados, pero te quitara todas tus asociaciones y luego tendrías que volverlas a poner a medida que le des uso normal al equipo y te vaya preguntado, eso se hace desde:
Configuración > Aplicaciones > Aplicaciones predeterminadas > Restablecer los valores predeterminados.
Hay una opción de quitar la asociación desde el registro de Windows, pero nunca la probé.
Pero en tu caso no creo que sea culpa de la asociación a los archivos al json, sino más bien cosa del navegador, a ti tu navegador cuando pinchas en un archivo json debería de darte la opción de descargar o de abrir, en caso de elegir abrir entonces sí que debería de abrírtelo con el programa que tu uses como predeterminado, pero no antes.
Si tienes dos navegadores web, prueba con el otro si también te descarga directamente.
Saludos